Omics Analysis Skills Index
De la autor
Skills for single-cell and spatial omics data analysis. Best practices, code snippets, and workflows for the scverse ecosystem.
Instalare
npx skills add BioTender-max/awesome-bio-agent-skills --skill 'Omics Analysis Skills Index' -a claude-code
Se instalează în .claude/skills/Omics-Analysis-Skills-Index/ · Fiecare comandă descarcă skill-ul direct de pe GitHub cu utilitarul open source skills.
Fără descărcare: licența acestui skill (Personalizată sau neclară) nu ne permite să-i redistribuim fișierele. Comenzile de instalare le iau direct de pe GitHub.
Vrei ca agentul să-ți propună skill-uri în timp ce scrii? Vezi cum folosești skill-urile din IDE.
Verificări de siguranță pe SKILL.md
Niciun avertisment.
De ce 74
aiqbench calculează scorul de încredere din semnale publice. Nu este un audit de securitate, așa că citește un skill înainte să-l instalezi.
Skill-uri similare
Cele mai apropiate de acesta prin ce fac și când sunt folosite.
- Spatial Omics Skills IndexBioTender-max/awesome-bio-agent-skillsSkills for spatial transcriptomics analysis including single-cell to spatial mapping (MOSCOT), 3D visualization (PyVista), and related spatial workflows.Altele★ 215
- Single-Cell Foundation Models Skills IndexBioTender-max/awesome-bio-agent-skillsWorkflow guidance and model reference for single-cell foundation models (scGPT, Geneformer, UCE, scBERT, etc.). Covers model selection, validation-first workflow, and per-model I/O contracts.Productivitate★ 215
- scvi-toolsK-Dense-AI/scientific-agent-skillsFits probabilistic models for single-cell omics, including scVI batch integration, scANVI annotation, totalVI CITE-seq, MultiVI RNA/ATAC integration, and posterior differential expression. Use for generative modeling, reference mapping, multimodal analysis, or model-based uncertainty; use scanpy for standard preprocessing and exploratory analysis.Altele★ 56.2K
- OpenST Skills IndexBioTender-max/awesome-bio-agent-skillsSkills for Open-ST spatial transcriptomics data processing, from raw BCL files to spatially-resolved single-cell h5ad objects.Altele★ 215
- nf-core Pipelines Skills IndexBioTender-max/awesome-bio-agent-skillsSkills for using nf-core community pipelines to process omics data, from installation and configuration to running specific analysis pipelines.Planificare★ 215
- anndataK-Dense-AI/scientific-agent-skillsHandles annotated matrices in single-cell analysis, .h5ad and Zarr files, and integration with the scverse ecosystem. This is the data format skill—for analysis workflows use scanpy; for probabilistic models use scvi-tools; for population-scale queries use cellxgene-census.Altele★ 56.2K
Note și recenzii
—
nicio recenzie
Ai încercat acest skill? Notează-l ca să-i ajuți pe alții. Autentifică-te
Discuție
Intră în discuție. Autentifică-te