De la autor
ATAC-seq processing with assay QC, MACS3 peak calling, consensus peak matrices, differential accessibility, and motif or footprint follow-up.
Instalare
npx skills add BioTender-max/awesome-bio-agent-skills --skill atac-seq -a claude-code
Se instalează în .claude/skills/atac-seq/ · Fiecare comandă descarcă skill-ul direct de pe GitHub cu utilitarul open source skills.
Fără descărcare: licența acestui skill (Personalizată sau neclară) nu ne permite să-i redistribuim fișierele. Comenzile de instalare le iau direct de pe GitHub.
Vrei ca agentul să-ți propună skill-uri în timp ce scrii? Vezi cum folosești skill-urile din IDE.
Verificări de siguranță pe SKILL.md
Niciun avertisment.
De ce 74
aiqbench calculează scorul de încredere din semnale publice. Nu este un audit de securitate, așa că citește un skill înainte să-l instalezi.
Skill-uri similare
Cele mai apropiate de acesta prin ce fac și când sunt folosite.
- chip-seqBioTender-max/awesome-bio-agent-skillsChIP-seq peak calling and downstream interpretation with MACS3, signal track export, annotation, motif analysis, and differential binding review.Inginerie★ 215
- macs3-peak-callingjaechang-hits/SciAgent-SkillsPoisson-model peak caller for ChIP-seq/ATAC-seq BAMs. MACS3 callpeak finds enriched regions (TF sites or histone marks) vs input/IgG; outputs BED narrowPeak/broadPeak for motif analysis, annotation, and differential binding. Use narrow peaks for TF ChIP-seq and ATAC-seq; broad for H3K27me3, H3K9me3, and other broad marks.Altele★ 385
- seq-wrangleraAAaqwq/AGI-Super-TeamSequence QC, alignment, and BAM processing. Wraps FastQC, BWA/Bowtie2, SAMtools for automated read-to-BAM pipelines.Altele★ 114
- atc-experimentsbrycewang-stanford/Awesome-Journal-SkillsUse when designing or auditing the evaluation of an ATC (ACM SIGOPS Annual Technical Conference, formerly USENIX ATC) systems paper — matching evidence to the claim with real testbeds, fair baselines, end-to-end plus microbenchmark results, tail-latency and variance reporting, workload realism, and honest cost accounting.Știință★ 1.4K
- bio-atac-seq-atac-qcBioTender-max/awesome-bio-agent-skillsATAC-seq library quality control -- TSS enrichment, FRiP, fragment-size periodicity, library complexity (NRF/PBC1/PBC2), mitochondrial fraction, and ENCODE 4 thresholds. Use when assessing whether an ATAC-seq library passes ENCODE acceptance criteria, diagnosing transposition artefacts, comparing Omni-ATAC vs standard prep quality, or selecting which replicates to drop before peak calling.Altele★ 215
- rnaseq-deComeOnOliver/skillshubDifferential expression analysis for bulk RNA-seq and pseudo-bulk count matrices with QC, PCA, and contrast testing.Testare★ 65
Note și recenzii
—
nicio recenzie
Ai încercat acest skill? Notează-l ca să-i ajuți pe alții. Autentifică-te
Discuție
Intră în discuție. Autentifică-te