quickgo-database
De la autor
Query EBI QuickGO REST API for GO terms and protein annotations. Fetch term metadata by ID, search by keyword, walk ancestor/descendant hierarchies, download annotations filtered by taxon, evidence code, aspect. Use for GO resolution, ontology traversal, annotation retrieval before enrichment. Use gseapy-gene-enrichment for enrichment; uniprot-protein-database for proteins.
Instalare
npx skills add jaechang-hits/SciAgent-Skills --skill quickgo-database -a claude-code
Se instalează în .claude/skills/quickgo-database/ · Fiecare comandă descarcă skill-ul direct de pe GitHub cu utilitarul open source skills.
Identic octet cu octet cu commit-ul scanat, cu licența depozitului și un fișier SOURCE.txt.
Vrei ca agentul să-ți propună skill-uri în timp ce scrii? Vezi cum folosești skill-urile din IDE.
Verificări de siguranță pe SKILL.md
Niciun avertisment.
De ce 86
aiqbench calculează scorul de încredere din semnale publice. Nu este un audit de securitate, așa că citește un skill înainte să-l instalezi.
Skill-uri similare
Cele mai apropiate de acesta prin ce fac și când sunt folosite.
- uniprot-protein-databasejaechang-hits/SciAgent-SkillsQuery UniProt REST API: search by gene/protein name, fetch FASTA, map IDs (Ensembl, PDB, RefSeq), access Swiss-Prot annotations. Use bioservices for multi-DB access; alphafold-database-access for structures.Date★ 382
- reactome-databasejaechang-hits/SciAgent-SkillsQuery Reactome pathways via REST: pathway queries, entity lookup, keyword search, gene list enrichment, hierarchy, cross-refs. Content + Analysis services. Python wrapper: reactome2py. For KEGG use kegg-database; for PPIs use string-database-ppi.Date★ 382
- kegg-databasejaechang-hits/SciAgent-SkillsKEGG REST API (academic only). Pathways, genes, compounds, enzymes, diseases, drugs via 7 ops (info/list/find/get/conv/link/ddi). ID conversion (NCBI/UniProt/PubChem). Use bioservices for multi-DB Python.Date★ 382
- ena-databaseforyourhealth111-pixel/Vibe-SkillsAccess European Nucleotide Archive via API/FTP. Retrieve DNA/RNA sequences, raw reads (FASTQ), genome assemblies by accession, for genomics and bioinformatics pipelines. Supports multiple formats.Date★ 3.8K
- interpro-databasejaechang-hits/SciAgent-SkillsQuery InterPro REST API for protein domain architecture, family classification, and member-DB integration. Search entries, retrieve a protein's domains, list family members, get taxonomic distribution, link to PDB. Unifies Pfam, PANTHER, PIRSF, PRINTS, PROSITE, SMART, CDD, NCBIfam. Use uniprot-protein-database for sequences; pdb-database for 3D structures.Date★ 382
- emdb-databasejaechang-hits/SciAgent-SkillsLook up EMDB cryo-EM density maps and fitted atomic models via the entry REST API + EBI Search WS. Fetch entry metadata (resolution, method, organism, sample), map download URLs, fitted PDB IDs, and citations. Keyword search via EBI Search. No auth. For atomic coordinates use pdb-database; for AlphaFold predictions use alphafold-database-access.Date★ 382
Note și recenzii
—
nicio recenzie
Ai încercat acest skill? Notează-l ca să-i ajuți pe alții. Autentifică-te
Discuție
Intră în discuție. Autentifică-te